LAB / BUILDING MY DIGITAL SELF

从真实工作开始，构建数字分身。

我的长期目标是打造自己的数字分身，从多肽科研开始，逐步连接知识、思考与行动。这里记录真实工作、可复用能力与验证边界，也保留尚未解决的问题。

LAB / BUILD LOG

建设活跃度

研发能力与知识经验，一点点积累。

agentic_ai_platform

研发能力 · 方法与执行

30天 · Commits

Commits: 2786
新建 PR: 290
合并 PR: 267

每条轨道按自身峰值着色；颜色深浅不能横向比较。

knowledge_wiki

知识经验 · 来源与积累

30天 · Commits

Commits: 11
新建 PR: 3
合并 PR: 2

每条轨道按自身峰值着色；颜色深浅不能横向比较。

2026-10-28 UTC 部分日

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更新于：2026-10-28T20:10:02.570671+00:00 · UTC · — 暂无数据

A TREE IN THE MAKING

把好奇心，长成一棵树。

每片枫叶，是一种方法。新的能力，会沿着有据的工作慢慢生长。

靶点与位点1 基因组线索4 检索与实验筛选2 分子生成15 序列设计与表征8 结构与独立评价12 物理与能量3 先导与实验反馈6 化学与分子身份1 共享支撑11

根扎在真实工作里。

循着一片叶子，看看它能做什么。

63 种方法 · 跨研发阶段只计一次

叶子记录方法，不代表实验已经验证。命中验证、hit-to-lead 与先导优化各有边界；实验反馈可以回到任何一轮。

01靶点与位点1

靶点与位点判断

靶点或复合物结构与链映射 → 接触、SASA 与表位热点判断。

生物学建议、几何与接触证据不等于因果靶点验证或 MD 模拟。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

02基因组线索4

基因组调控信号预测

模型专属 DNA 或变异、轨道身份与资产 → 调控信号或变异效应预测。

Enformer、Borzoi 与 Flashzoi 是不同原生操作；基因组信号不是蛋白结合或因果验证。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

染色质可及性预测

参考 DNA、染色体大小、峰与模型资产 → ChromBPNet 轮廓和轨道预测。

参考序列与峰身份必须匹配；预测可及性不是因果或蛋白结合结果。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

DNA 生成与表征

DNA 序列、指定层或生成控制与资产 → DNA 生成、似然或分层表征。

这项操作不对蛋白评分；生成和表征不是表型或结合测量。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

基因组变异效应预测

指定 hg38 参考、变异与模型资产 → GPN Star 变异效应预测。

仅保留已声明的主要 hg38 接口；其他模型或表征未取得资格。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

03检索与实验筛选2

已有多肽检索

已登记的序列或化学检索空间与查询 → 来源明确的匹配记录。

检索匹配不是已确认的结合命中。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

展示筛选与富集分析

筛选前后计数、选择路径与对照 → 富集表、质量检查及候选证据。

富集需要背景对照与正交结合验证。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

04分子生成15

联合生成序列与结构

显式单体、结合物或基序任务与采样条件 → 联合序列/结构候选及完整身份。

仅天然 L 蛋白；原生资格待完成，环肽与非天然化学拒绝。软件接线不证明真实原生恢复、科学适用性或默认方法可替换。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

全原子骨架生成

靶标结构与显式生成约束 → 候选结构、序列及来源。

软件源码与控制接口不证明原生环肽支持或实验亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

预测反馈驱动设计

靶标结构、设计与拓扑契约 → 候选序列、结构及尝试记录。

扩展请求与源码支持不等于原生配方合格；不能静默回退到旧版。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

环肽基序支架设计

基序、支架与环化拓扑约束 → 支架候选与约束证据。

闭合几何不证明可合成性或结合。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

全原子骨架设计

RFD3 设计规格或 RF3 命名分子 → 骨架设计或预测结构与样本来源。

RFD3 生成与 RoseTTAFold3 的 RF3 预测不同；环肽化学需专门准入。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

条件环肽生成

靶标、序列条件与明确环肽流匹配配方 → 结构候选和来源证据。

所选软件候选尚未取得原生资格；环肽 ODE 条件化不是结合测量。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

梯度驱动结合物设计

靶标结构、序列 logits 与梯度目标 → 候选序列和预测结构。

设计反馈不是独立重折叠或实验亲和力；拓扑和恢复条件必须显式保留。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

结构反馈梯度设计

靶标结构、链角色、结合物长度与梯度计划 → 设计序列和最终预测结构。

这是有限梯度操作，不是完整 BindCraft 项目控制器；置信度不是实验亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

骨架与部分扩散设计

靶标或基序坐标、片段规格与扩散控制 → 蛋白骨架候选及样本来源。

骨架生成还需下游序列设计和独立评价；原生约束支持有适用条件。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

条件蛋白骨架生成

指定源码配置、条件输入、种子与模型资产 → Genie3 骨架候选及来源。

原生搜索、采样器和条件控制仍由上游实现负责；软件就绪不是原生或科学资格。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

可微结合物设计

靶标与序列设计输入、种子及明确配方 → Mosaic 设计与完成证据契约。

科学适用性待验证；完成单元复用不是原生作业内检查点恢复。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

靶标条件蛋白设计

原生设计输入、指定资产与数值精度控制 → PXDesign 结构与输出来源。

必须具备所选设计依赖；软件迁移不证明亲和力或原生资格。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

序列与结构反馈设计

明确受体与肽链、拓扑、循环数与预测设置 → 逐轮序列、预测与选择证据。

MPNN 打包与 AF3 或 ESMFold2 前向反馈不提供序列梯度；授权由父工作流负责。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

结合物与环肽设计研究

经校验设计输入与明确环肽条件 → BoltzDesign1 调用和环境契约。

研究阶段；生产生成器未准入。所选源码许可及原生输出绑定有缺口，商业使用仍待定；不同于 BoltzGen。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

靶标条件多肽生成

靶蛋白序列、肽长度、数量与模型资产 → PepMLM 肽序列候选及来源。

所选源码许可与原生资格尚未解决；困惑度不是亲和力，生成本身不是确认结合物。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

05序列设计与表征8

序列采样与物理精修

给定骨架、固定位置与采样协议 → 条件序列及可选松弛结构。

骨架条件采样本身不是完整结合物生成流程。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

序列兼容性评分

序列与模型专属条件 → 带模型和残基索引来源的兼容性评分。

似然与表征不测量亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

固定骨架逆折叠

蛋白骨架、链角色、固定位置与采样条件 → ProteinMPNN 序列或评分。

骨架条件采样不是完整结合物生成器；评分不是亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

蛋白序列表征

蛋白序列、指定 ESMC 操作与资产 → 序列表征或操作专属评分。

离线表征不提交计算，也不改变常驻模型准入；似然和表征不是亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

前缀条件序列生成

可选序列前缀、模型身份与采样协议 → 生成序列或双向平均似然。

无条件或前缀生成不是靶标条件结合物设计；似然不是结合能。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

骨架条件逆折叠

骨架坐标、链与序列条件 → ESM-IF1 条件序列或似然。

必须提供骨架；似然不是亲和力。原生证据仅适用于对应源码、权重、操作、设备与夹具，不证明预测准确性。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

结构条件序列设计

已登记结构、指定模型资产与设计请求 → 结构条件蛋白序列。

结构条件设计不证明结合物活性或原生资格。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

蛋白序列评分与表征

蛋白序列操作与指定模型资产 → E1 操作专属评分、表征或预测。

基于 Profluent E1；软件传输不证明准确性或实验亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

06结构与独立评价12

候选评价与证据核对

候选、分子身份与已有证据 → 标准化评价包及明确资格缺口。

计算置信度不能建立实验结合结论。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

构象一致性与采样

分子序列或起始结构与显式模式 → 构象预测、一致性或采样证据。

一致性模式不采样构象；置信度不是亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

复合物结构预测

明确实体、种子与样本数量 → AF3 原生结构输出清单和协议身份。

这是输入输出协议边界；原生化学支持与模型资格仍需分别验证。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

模板条件结构预测

分子实体、模板、种子与指定资产 → Protenix 请求和完整结构输出契约。

模板命中与化学原子有效性需要原生特征化证据。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

复合物结构预测

OpenBind 实体、模型资产与明确数值模式 → 绑定请求与完整输出契约。

OpenBind 不同于 preview2；化学、数值模式与权重都需验证。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

序列到结构预测

蛋白序列、指定资产与折叠协议 → ESMFold2 结构请求与模型身份。

前向折叠不同于梯度设计；置信度不是亲和力。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

环肽复合物预测

分子实体、化学键与明确采样协议 → 带原子和采样来源的 Boltz2 结构。

环肽软件适配层不证明原生化学支持或结合准确性。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

坐标条件结构预测

序列、指定特征、可选初始坐标与折叠协议 → AF2 前向结构预测契约。

坐标播种的前向预测不同于 ColabDesign 梯度设计；资格单独核验。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

蛋白结构预测

明确折叠任务、输入、种子、样本与资产 → AtlasFold 完整预测输出契约。

调用传输与输出计数不证明科学准确性、数值等价或恢复。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

多实体复合物预测

分子实体、明确种子、样本与资产 → Chai-1 结构及实体/样本清单。

源码与传输检查不证明化学准确性、亲和力或检查点恢复。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

蛋白结构预测

分子输入、种子、样本与指定资产 → OpenDDE 结构和完整单元计数。

迁移后的 bf16 fast_layernorm 不同于上游 fp32；科学资格与原生长任务恢复另核。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

独立对接交叉检查

声明的结构、位点与约束 → ADCP、HADDOCK3 或 LightDock 构象交叉检查。

对接检验构象证据，不作为亲和力排序。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

07物理与能量3

自由能与稳定性分析

分子体系、力场与声明物理协议 → 协议绑定能量估计与诊断。

折叠稳定性变化与结合自由能变化不同；不同协议不能隐式融合。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

副本交换动力学

明确拓扑、温度梯与物理协议 → 副本交换模拟与分析。

作业恢复与轨迹结果分别验收，提交成功不是科学结论。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

08先导与实验反馈6

先导项目与实验轮次

测定证据、目标与研究者设计卡 → 可恢复项目、轮次与设计面板。

项目与推理辅助工具不启动计算，也不下单合成；建议与实测结果分开保留。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

多方法界面优化

父代复合物、显式操作与评价契约 → 候选池、来源及评价证据。

父代优化与从头生成是不同任务。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

成药性端点评估

完整 SMILES、支持数据与固定配方 → 端点预测、拒绝状态及来源。

肽与非天然氨基酸迁移未验证；端点定义不等于部署资格，在线部署另核。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 待验证

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

实验构效关系分析

带来源、单位与删失信息的测定数据 → 区分实测和推断的构效关系。

跨测定条件的数值不可互换；建议尚未实测。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

统一残基扫描

显式位点、上下文与评分方法 → 完整突变矩阵、覆盖与排序。

保留结合与折叠等不同量，不隐式融合；原生资格依方法分别核对。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

实验与结构驱动设计

实验 SAR、结构证据与假设 → 可追溯的设计建议与分子身份。

建议尚未经评价；结构解释需独立归因与核对。

方法与证据

在研究中负责 · 组合任务

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

09化学与分子身份1

环化桥接位点选择

复合物几何与候选桥接化学 → 桥接位点对排序与可行性观察。

位点选择不同于闭合验证、合成可行性与结合证据。

方法与证据

在研究中负责 · 科学操作

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

10共享支撑11

科研图表与报告

已核验主张、图表与证据引用 → 主张与图表可追溯的报告。

渲染出的报告不能关闭上游未完成的科学验收。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

假设、发现与负结果

来源绑定的假设与发现卡 → 可持续保留的科研上下文。

记录假设不等于验证结论。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

知识库积累有出处的经验与方法，让下一次研发可以继续接上。

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

目标、恢复与验收

已授权目标契约、任务状态与证据 → 可恢复执行和验收记录。

工作流完成不单独证明科学结果合格。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

计算准入与作业恢复

有归属的工作负载、实测容量与预算 → 作业描述、结果和恢复状态。

进程成功退出不能建立科学有效性。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

模型权重身份与来源

已登记的逻辑模型名 → 明确模型和权重身份。

登记不证明运行环境已安装或推理成功。

方法与证据

在研究中负责 · 共享契约

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

在线服务发现

已授权服务发现与身份 → 明确服务路由与运行证据。

端点可达不等于科学预测已经合格。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

经验检索与采用证据

问题与维护中的知识来源 → 按相关性排列的经验和证据引用。

检索、发布、实际采用与测得效果是不同状态。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

数据与评测资产

逻辑数据名与访问上下文 → 已登记数据身份及访问结果。

登记不等于数据质量合格，也不授权访问受限数据。

方法与证据

在研究中负责 · 共享契约

数据资产、评测与来源追踪，为可比较、可复现的研究提供基础。

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

分子拓扑与坐标身份

分子图、链、残基与共价声明 → 身份映射及拓扑校验记录。

分子图有效不证明化学合成可行。

方法与证据

在研究中负责 · 共享契约

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

科研轮次与候选谱系

轮次身份、父代谱系与内容绑定证据 → 持久化轮次记录及显式历史转换。

科研轮次不创建根任务迭代或回退；记录不授予计算或科学决策权限。

方法与证据

在研究中负责 · 运行与学习支撑

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

评测归一化协议

标量值与明确冻结或训练集极值 → 协议绑定的归一化或逆变换。

归一化不是科学模型；极值与 affine-v2 截断协议必须明确，历史 v1 只读。

方法与证据

在研究中负责 · 共享契约

能力登记或实现源码已核对；登记不代表原生运行。

实现: 契约已登记
测试: 未独立核验
部署: 未知
真实运行: 未独立核验
科学验证: 未独立核验

来源核对 · 2026-10-27

未附公开执行证据。

关于这棵树

有据的新能力经过复核后才会添上新叶。来源变化、核对与发布分别记录，页面随日更呈现；微风只是装饰。

来源变更: 时间未核实
来源核对: 2026-10-27 13:49:50 UTC
发布回执: 本快照尚未绑定

快照待更新；保留上次已核对内容。

GROWING / QUESTIONS INTO CAPABILITIES

方法在积累，枝叶在生长。

已整理 63 项有来源的方法与支撑能力。新的验证、行为变化与限制会在复核后记入这里。

探索枫叶能力树 ↗

能力来源核对 · 2026-10-27 · 快照待更新

RECENT WORK / 2026-10-28

最近在解决什么，走到了哪一步。

记录截至 2026-10-28。

2026-10-28规划

磁盘报告与工具说明

方案: 核对这一工程提案的源码整合状态，并保留后续验收所需的记录。
进展与边界: 本次只读取了标题、状态与时间；没有据此确认部署、测试通过、模型运行或科研效果。
接下来: 在原任务范围内核对后续审查、整合与运行证据。

查看完整记录 ↗

2026-10-28规划

自检结果核对

方案: 核对这一工程提案的源码整合状态，并保留后续验收所需的记录。
进展与边界: 本次只读取了标题、状态与时间；没有据此确认部署、测试通过、模型运行或科研效果。
接下来: 在原任务范围内核对后续审查、整合与运行证据。

查看完整记录 ↗

2026-10-28已合并

磁盘检查与工作目录整理

方案: 核对这一工程提案的源码整合状态，并保留后续验收所需的记录。
进展与边界: 本次只读取了标题、状态与时间；没有据此确认部署、测试通过、模型运行或科研效果。
接下来: 在原任务范围内核对后续审查、整合与运行证据。

查看完整记录 ↗

按日期翻翻原记录

选定记录 · 截至 2026-10-28

周战报 · 2026-10-26 → 2026-11-01

记录截至 2026-10-28 · 选定记录

月度升级日志 · 2026-10-01 → 2026-10-31

记录截至 2026-10-28 · 选定记录

COGNITIVE SYSTEM / METHODS & HARNESS EVOLUTION

把经验变成可评价的改进候选。

连接经验、蒸馏、诊断与评价，让系统持续提出可检验的改进。这一闭环仍在建设。

经验记录
保留任务输出、证据、失败与适用边界。
蒸馏知识
将可复用经验整理为有来源的知识与方法。
诊断缺口
对照任务需求，识别方法或能力缺口。
自我模型
记录系统能力与限制，支持后续任务选择。
候选改进
提出 skills、工具或工作流的版本化变更。
固定条件评价
独立比较候选与基线；评价器也需要检验。

从真实工作开始，构建数字分身。

建设活跃度

agentic_ai_platform

knowledge_wiki

2026-10-28 UTC 部分日

方法在积累，枝叶在生长。

最近在解决什么，走到了哪一步。

磁盘报告与工具说明

自检结果核对

磁盘检查与工作目录整理

把经验变成可评价的改进候选。

改了什么，怎样验证？