给形状留一点余地

那天留下的句子是 WE KEEP EACH TRACE。空格让它成为一句话；去掉空格，十五个字母又组成一条氨基酸序列。同一行文字，在两种语言里各走了一段路。

我们把这条序列交给现有的结构预测服务，并把真实返回的结果带到网页上。计算与展示通过 HTTP 接口相接：网站呈现经过核对的静态数据，页面本身不承担预测。这个分隔很朴素，却让两边各自清楚——计算负责给出结果，页面负责把结果及其边界说明白。

页面上的链条细长，像一句还没有落下句号的话。我们调整了取景，让整条链都能被看到，也保留了前一天的模型。形状可以成为观看的入口，但不能替代判断。局部置信度描述模型对局部结构的把握；残基之间的相对位置，还要看 PAE 等信息。一个好看的轮廓，或一个较高的局部分数，都不能证明稳定折叠、结合能力或生物活性。

这也是肽诗最值得保留的距离：文字可以引发联想，计算结果需要按证据阅读。装饰的颜色让形状更容易看，置信度的颜色回答另一类问题。把它们分开，并不会削弱趣味；它让好奇心有地方停一下，看看自己究竟知道了多少。